質(zhì)粒小提中量試劑盒的制備工藝主要基于堿裂解法,通過一系列精確控制的步驟實(shí)現(xiàn)高效、高純度的質(zhì)粒DNA提取。以下是其核心工藝流程及關(guān)鍵要點(diǎn):
1.菌體收集與預(yù)處理
離心沉淀培養(yǎng)物:取一定體積(如5–30 mL)過夜培養(yǎng)的大腸桿菌菌液,使用臺(tái)式離心機(jī)高速離心后去除上清液,保留底部菌體沉淀。若菌液量較大,可通過多次離心集中到同一管中以提高回收率。
重懸細(xì)胞并滅活核酸酶:向含菌體的離心管中加入預(yù)冷的Solution I(含RNase A),充分渦旋或吹打使菌塊全分散。RNase A的作用是降解RNA雜質(zhì),避免后續(xù)實(shí)驗(yàn)干擾;而溶液中的EDTA則螯合二價(jià)金屬離子以抑制DNase活性,防止質(zhì)粒降解。
2.質(zhì)粒小提中量試劑盒細(xì)胞裂解與中和反應(yīng)
堿性裂解細(xì)胞膜:加入Solution II(含NaOH和SDS),溫和翻轉(zhuǎn)混合數(shù)次直至液體變清亮黏稠。此步驟利用強(qiáng)堿破壞細(xì)胞壁及膜結(jié)構(gòu),使胞內(nèi)物質(zhì)釋放。需嚴(yán)格控制作用時(shí)間不超過5分鐘,避免基因組DNA斷裂成碎片污染產(chǎn)物。
終止反應(yīng)形成復(fù)合物:迅速加入Solution III(醋酸鉀溶液),立即輕柔混勻后產(chǎn)生白色絮狀沉淀。該步驟通過高鹽環(huán)境促使蛋白質(zhì)、基因組DNA等雜質(zhì)共沉淀,同時(shí)中和堿性條件保護(hù)目標(biāo)質(zhì)粒免受損傷。離心后取上清轉(zhuǎn)移至吸附柱,避免吸入沉淀顆粒。
3.柱層析純化過程
選擇性吸附DNA:將裂解后的上清液加載到含有硅基質(zhì)材料的離心吸附柱中。在高鹽條件下,硅膠特異性結(jié)合質(zhì)粒DNA,而其他雜質(zhì)隨濾液排出。可選步驟包括加入去蛋白液進(jìn)一步清除殘留蛋白質(zhì),尤其適用于表達(dá)內(nèi)源性核酸酶的宿主菌株(如endA+型)。
洗滌去除殘留污染物:依次用含乙醇的漂洗液多次沖洗吸附柱,去除鹽分、微量蛋白質(zhì)及代謝副產(chǎn)物。離心后敞開管蓋靜置數(shù)分鐘,確保乙醇全揮發(fā),以免影響下游酶切或測(cè)序反應(yīng)。
4.質(zhì)粒小提中量試劑盒洗脫與回收質(zhì)粒
高效釋放目標(biāo)產(chǎn)物:向干燥后的吸附柱中央滴加預(yù)熱至60℃的洗脫緩沖液或無菌水,室溫孵育后離心收集含質(zhì)粒的溶液。為提升回收率,可將洗脫液重新過柱并二次離心。最終獲得的質(zhì)粒溶液濃度可達(dá)5μg/μL以上,超螺旋比例較高且無內(nèi)毒素污染。
5.質(zhì)量控制與保存
濃度測(cè)定:通過紫外分光光度計(jì)檢測(cè)OD260值,結(jié)合瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證條帶完整性。理想樣本應(yīng)顯示清晰的超螺旋主帶,無明顯基因組拖尾現(xiàn)象。
低溫儲(chǔ)存:短期內(nèi)使用的質(zhì)粒可置于4℃,長(zhǎng)期保存建議分裝后凍存于-20℃,避免反復(fù)凍融導(dǎo)致降解。
